Stenapan börjar dramatiskt. Ett gammalt kinesiskt lastfartyg är på väg mot New Yorks hamn. Ombord på farytget finns illegala kinsesiska flyktingar och den ökände flyktingsmugglaren Spöket. När de närmar sig kusten ser de att de upptäckts och innan kustjägarna hinner fatt i fartyget så spränger Spöket det i luften. Flyktingarna är inlåsta i lastutrymmet, men några lykas ta sig ut och ombord på en räddningsbåt. Spöket tar sig även han i land. Driven av hämnd och annan ondskfullhet bestämmer han sig för att inte låta någon av flyktingarna, som han kallar för smågrisarna, komma undan. Målmedvetet och hänsysnlöst jagar han efter dem i China Town. Samtidigt får vi följa den helförlamade och rullstolsbundne kriminalteknikern Lincoln Rhymes, hans kollega och flickvän Amelia Sachs och ett utredningsteam betsående av folk från FBI och "migrationsverket" i deras jakt efter Spöket som gjort sig skyldig till flertalet fall av människosmuggling och mord. Stenapan är dramatisk men ä