Idi na sadržaj

CPSF7

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
CPSF7
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

3N9U

Identifikatori
AliasiCPSF7
Vanjski ID-jeviMGI: 1917826 HomoloGene: 11731 GeneCards: CPSF7
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 11 (čovjek)
Hrom.Hromosom 11 (čovjek)[1]
Hromosom 11 (čovjek)
Genomska lokacija za CPSF7
Genomska lokacija za CPSF7
Bend11q12.2Početak61,402,641 bp[1]
Kraj61,430,031 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 19 (miš)
Hrom.Hromosom 19 (miš)[2]
Hromosom 19 (miš)
Genomska lokacija za CPSF7
Genomska lokacija za CPSF7
Bend19|19 APočetak10,502,630 bp[2]
Kraj10,525,017 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
nucleic acid binding
vezivanje sa RNK
Ćelijska komponenta membrana
jedro
nukleoplazma
mRNA cleavage factor complex
citoplazma
mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex
Biološki proces mRNA splicing, via spliceosome
termination of RNA polymerase II transcription
mRNA processing
mRNA 3'-end processing
protein tetramerization
protein heterotetramerization
pre-mRNA cleavage required for polyadenylation
mRNA alternative polyadenylation
messenger ribonucleoprotein complex assembly
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001136040
NM_001142565
NM_024811

NM_001164272
NM_172302
NM_001362450

RefSeq (bjelančevina)

NP_001129512
NP_001136037
NP_079087

NP_001157744
NP_758506
NP_001349379

Lokacija (UCSC)Chr 11: 61.4 – 61.43 MbChr 19: 10.5 – 10.53 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Podjedinica 7 faktora specifičnosti cijepanja i poliadenilacije je protein koji je kod ljudi kodiran genom CPSF7.[5][6]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 471 aminokiselina, a molekulska težina 52.050 Da.[7]

1020304050
MSEGVDLIDIYADEEFNQDPEFNNTDQIDLYDDVLTATSQPSDDRSSSTE
PPPPVRQEPSPKPNNKTPAILYTYSGLRNRRAAVYVGSFSWWTTDQQLIQ
VIRSIGVYDVVELKFAENRANGQSKGYAEVVVASENSVHKLLELLPGKVL
NGEKVDVRPATRQNLSQFEAQARKRECVRVPRGGIPPRAHSRDSSDSADG
RATPSENLVPSSARVDKPPSVLPYFNRPPSALPLMGLPPPPIPPPPPLSS
SFGVPPPPPGIHYQHLMPPPPRLPPHLAVPPPGAIPPALHLNPAFFPPPN
ATVGPPPDTYMKASAPYNHHGSRDSGPPPSTVSEAEFEDIMKRNRAISSS
AISKAVSGASAGDYSDAIETLLTAIAVIKQSRVANDERCRVLISSLKDCL
HGIEAKSYSVGASGSSSRKRHRSRERSPSRSRESSRRHRDLLHNEDRHDD
YFQERNREHERHRDRERDRHH

Funkcija

[uredi | uredi izvor]

CPSF7, takođe poznat i kao CFIm59, je faktor cijepanja dva blisko povezana proteinska kompleksA u 3' netranslatiranoj regiji molekuli novosintetizirane pre-iRNK, koja se koristi u transkripciji gena.[8] CPSF7 je jedan od tri faktora specifičnosti cijepanja i poliadenilacije (CPSF), a druga dva su CFIm25 (ili CPSF5/NUDT21) i CFIm68 (ili CPSF6).

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000149532 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000034820 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, et al. (decembar 2002). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
  6. ^ "Entrez Gene: FLJ12529 pre-mRNA cleavage factor I, 59 kDa subunit".
  7. ^ "UniProt, Q8N684". Pristupljeno 20. 8. 2021.
  8. ^ Hardy JG, Norbury CJ (august 2016). "Cleavage factor Im (CFIm) as a regulator of alternative polyadenylation". Biochemical Society Transactions. 44 (4): 1051–7. doi:10.1042/BST20160078. PMID 27528751.

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]